فرآیند تشریفات گمرکی منجر به‌ترخیص قطعی کالا از گمرک علی‌رغم مساعی مدیران و مسئولین گمرک که همواره سعی دارند، در حداقل زمان، کار تشریفات گمرکی پایان پذیرد، بعضاً در مواردی به‌سبب ایرادهایی که ناشی از درک نامناسب از مقررات و قوانین موجود یا اصول و قواعد طبقه‌بندی کالا در گمرک می‌باشد و بروز آنکه ممکن است از جانب هر یک از طرفین (گمرک یا صاحب کالا) بوده باشد، روند تشریفات را کند و ترخیص کالا را با چالش مواجه می‌سازد.

این وضعیت هر چند عمومیت ندارد ولی درصد قابل ملاحظه‌ای از اختلافات بین گمرک و صاحبان کالا را موجب می‌گردد که کمترین زیان ناشی از بروز اختلاف، تاخیر در ترخیص کالا از گمرک است که علاوه‌بر زیان مالی برای واردکنندگان، موجب خلل در برنامه‌ها و برنامه‌ریزی‌هایی خواهد شد که صاحبان کالا برای ورود و ترخیص به‌موقع کالا تنظیم و طراحی نموده‌اند.